Μια νέα εκκίνηση που ιδρύθηκε από έναν πρώην επιστήμονα της Google Deepmind βγαίνει από τη Stealth με χρηματοδότηση 50 εκατομμυρίων δολαρίων.
Το Latent Labs κατασκευάζει μοντέλα θεμελίωσης AI για να “κάνει προγραμματιζόμενη βιολογία”, και σχεδιάζει να συνεργαστεί με βιοτεχνολογικές και φαρμακευτικές εταιρείες για τη δημιουργία και τη βελτιστοποίηση των πρωτεϊνών.
Είναι αδύνατο να καταλάβουμε τι κάνουν το DeepMind και το Ilk χωρίς να κατανοούν πρώτα το ρόλο που παίζουν οι πρωτεΐνες στην ανθρώπινη βιολογία. Οι πρωτεΐνες οδηγούν τα πάντα σε ζωντανά κύτταρα, από ένζυμα και ορμόνες έως αντισώματα. Αποτελούνται από περίπου 20 ξεχωριστά αμινοξέα, τα οποία συνδέονται μαζί σε χορδές που διπλώνουν για να δημιουργήσουν μια δομή 3D, του οποίου το σχήμα καθορίζει τον τρόπο λειτουργίας της πρωτεΐνης.
Αλλά η κατανόηση του σχήματος κάθε πρωτεΐνης ήταν ιστορικά μια πολύ αργή, εργατική διαδικασία. Αυτή ήταν η μεγάλη ανακάλυψη που πέτυχε το DeepMind με το AlphaFold: έμαθε μηχανική μάθηση με πραγματικά βιολογικά δεδομένα για να προβλέψει το σχήμα περίπου 200 εκατομμυρίων πρωτεϊνικών δομών.
Οπλισμένοι με τέτοια δεδομένα, οι επιστήμονες μπορούν να κατανοήσουν καλύτερα τις ασθένειες, να σχεδιάσουν νέα φάρμακα και να δημιουργούν συνθετικές πρωτεΐνες για εντελώς νέες περιπτώσεις χρήσης. Αυτό είναι όπου τα λανθάνοντα εργαστήρια εισέρχονται στο χτύπημα με τη φιλοδοξία του να επιτρέψει στους ερευνητές να “δημιουργούν υπολογιστικά” νέα θεραπευτικά μόρια από το μηδέν.
Λανθάνουσα δυνατότητα
Ο Simon Kohl (που απεικονίζεται παραπάνω) ξεκίνησε ως ερευνητής στο DeepMind, συνεργαζόμενοι με την ομάδα του πυρήνα AlphaFold2 πριν από την ηγεσία της ομάδας σχεδιασμού πρωτεϊνών και τη δημιουργία του υγρού εργαστηρίου του DeepMind στο Ινστιτούτο Francis Crick του Λονδίνου. Γύρω από αυτό το διάστημα, η DeepMind δημιούργησε επίσης μια αδελφή εταιρεία με τη μορφή ισομορφικών εργαστηρίων, η οποία επικεντρώνεται στην εφαρμογή της έρευνας AI της DeepMind για τη μετατροπή της ανακάλυψης φαρμάκων.
Ήταν ένας συνδυασμός αυτών των εξελίξεων που έπεισαν τον Kohl ότι ο χρόνος ήταν σωστός να το πάει μόνος του με ένα πιο λιτό στολή που επικεντρώνεται ειδικά στην οικοδόμηση μοντέλων Frontier (IE, αιχμής) για το σχεδιασμό πρωτεϊνών. Έτσι, στην ουρά του 2022, ο Kohl αναχώρησε από το Deepmind για να βάλει τα θεμέλια για λανθάνοντα εργαστήρια και ενσωμάτωσε την επιχείρηση στο Λονδίνο στα μέσα του 2010.
“Είχα έναν φανταστικό και επιθετικό χρόνο (στο DeepMind) και έγινα πεπεισμένος για τον αντίκτυπο που θα είχε η γενετική μοντελοποίηση στη βιολογία και το σχεδιασμό πρωτεϊνών ειδικότερα”, δήλωσε ο Kohl στο TechCrunch σε συνέντευξή του αυτή την εβδομάδα. “Ταυτόχρονα, είδα ότι με την έναρξη των ισομορφικών εργαστηρίων και τα σχέδιά τους με βάση το AlphaFold2, ότι ξεκινούσαν πολλά πράγματα ταυτόχρονα. Ένιωσα ότι η ευκαιρία ήταν πραγματικά να πηγαίνω με τρόπο επικεντρωμένο στο λέιζερ για το σχεδιασμό πρωτεϊνών. Ο σχεδιασμός της πρωτεΐνης, από μόνο του, είναι ένα τόσο τεράστιο πεδίο και έχει τόσο ανεξερεύνητο λευκό χώρο που σκέφτηκα ότι μια πραγματικά ευκίνητη, εστιασμένη στολή θα μπορούσε να μεταφράσει αυτό το αντίκτυπο ».
Η μετάφραση αυτού του αντίκτυπου ως εκκίνησης που υποστηρίχθηκε από την επιχείρηση περιελάμβανε την πρόσληψη περίπου 15 υπαλλήλων, δύο από τους οποίους προέρχονταν από το DeepMind, ανώτερο μηχανικό από τη Microsoft και διδακτορικά από το Πανεπιστήμιο του Cambridge. Σήμερα, ο προσωπικός του Latent χωρίζεται σε δύο τοποθεσίες – ένα στο Λονδίνο, όπου συμβαίνει η μαγεία του Model Frontier και ένα άλλο στο Σαν Φρανσίσκο, με το δικό του υγρό εργαστήριο και την υπολογιστική ομάδα σχεδιασμού πρωτεϊνών.
“Αυτό μας επιτρέπει να δοκιμάσουμε τα μοντέλα μας στον πραγματικό κόσμο και να λάβουμε τα σχόλια που πρέπει να καταλάβουμε αν τα μοντέλα μας προχωρούν όπως θέλουμε”, δήλωσε ο Kohl.
Ενώ τα υγρά εργαστήρια βρίσκονται σε μεγάλο βαθμό στη βραχυπρόθεσμη ατζέντα όσον αφορά την επικύρωση των προβλέψεων της τεχνολογίας της Latent, ο απώτερος στόχος είναι να αναιρεί την ανάγκη για υγρά εργαστήρια.
“Η αποστολή μας είναι να κάνουμε προγραμματιζόμενη βιολογία, φέρνοντας πραγματικά τη βιολογία στην υπολογιστική σφαίρα, όπου η εξάρτηση από βιολογικά, υγρά πειράματα εργαστηρίου θα μειωθεί με την πάροδο του χρόνου”, δήλωσε ο Kohl.
Αυτό υπογραμμίζει ένα από τα βασικά οφέλη για την «καθιστώντας την προγραμματιζόμενη βιολογία»-αναβαθμίζοντας μια διαδικασία ανακάλυψης φαρμάκων που βασίζεται επί του παρόντος σε αμέτρητα πειράματα και επανάληψη που μπορεί να διαρκέσει χρόνια.
“Μας επιτρέπει να κάνουμε πραγματικά προσαρμοσμένα μόρια χωρίς να βασιζόμαστε στο υγρό εργαστήριο – τουλάχιστον, αυτό είναι το όραμα”, συνέχισε ο Kohl. “Φανταστείτε έναν κόσμο όπου κάποιος έρχεται με μια υπόθεση σχετικά με το τι στόχο φαρμάκων να ακολουθήσει μια συγκεκριμένη ασθένεια και τα μοντέλα μας θα μπορούσαν, με τρόπο” ώθησης “, να κάνουν ένα πρωτεϊνικό φάρμακο που έρχεται με όλες τις επιθυμητές ιδιότητες που ψήνονται μέσα . “
Η επιχείρηση της βιολογίας
Όσον αφορά το επιχειρηματικό μοντέλο, τα Latent Labs δεν θεωρούν τον εαυτό του ως “περιουσιακό στοιχείο”-που σημαίνει ότι δεν θα αναπτύξει τους δικούς του θεραπευτικούς υποψηφίους στο σπίτι. Αντ ‘αυτού, θέλει να συνεργαστεί με τρίτους συνεργάτες για να επιταχύνει και να αποδυναμώσει τα προηγούμενα στάδια Ε & Α.
“Πιστεύουμε ότι ο μεγαλύτερος αντίκτυπος που μπορούμε να έχουμε ως εταιρεία είναι επιτρέποντας σε άλλα βιοφάρμα, βιοτεχνολογίες και εταιρείες επιστήμης της ζωής-είτε δίνοντάς τους άμεση πρόσβαση στα μοντέλα μας είτε υποστηρίζοντας τα προγράμματα ανακάλυψης μέσω εταιρικών σχέσεων που βασίζονται σε έργα”, δήλωσε ο Kohl.
Η έγχυση μετρητών ύψους 50 εκατομμυρίων δολαρίων της εταιρείας περιλαμβάνει μια προηγουμένως αιφνιδιαστική δόση σπόρων ύψους 10 εκατομμυρίων δολαρίων και μια νέα σειρά 40 εκατομμυρίων δολαρίων, με στρογγυλές συν-ριζικές επιχειρήσεις-συγκεκριμένα, συνεργάτης Aaron Rosenberg, ο οποίος ήταν πρώην επικεφαλής της στρατηγικής και των επιχειρήσεων στο DeepMind.
Ο άλλος επενδυτής είναι η Sofinnova Partners, μια γαλλική εταιρεία VC με μακρά καταγραφή στο χώρο της Life Sciences. Άλλοι συμμετέχοντες στο γύρο περιλαμβάνουν τα Flying Fish, το Isomer, το 8VC, το Kindred Capital, το Pillar VC και τους αξιοσημείωτους αγγέλους, όπως ο επικεφαλής επιστήμονας της Google, Jeff Dean, ο ιδρυτής της Cohere Aidan Gomez και ο ιδρυτής της Elevenlabs Mati Staniszewski.
Ενώ ένα κομμάτι των μετρητών θα πάει προς τους μισθούς, συμπεριλαμβανομένων εκείνων των νέων μισθωτών μηχανικής μάθησης, θα χρειαστεί ένα σημαντικό χρηματικό ποσό για την κάλυψη της υποδομής.
“Ο υπολογιστής είναι ένα μεγάλο κόστος για εμάς – χτίζουμε αρκετά μεγάλα μοντέλα νομίζω ότι είναι δίκαιο να πούμε, και αυτό απαιτεί πολύ υπολογισμό GPU”, δήλωσε ο Kohl. “Αυτή η χρηματοδότηση μας θέτει πραγματικά μέχρι να διπλασιάσουμε τα πάντα-να αποκτήσουμε υπολογισμό για να συνεχίσουμε να κλιμακώνουμε το μοντέλο μας, να κλιμακώνουμε τις ομάδες και επίσης να αρχίσουμε να κατασκευάζουμε το εύρος ζώνης και την ικανότητα να έχουμε αυτές τις συνεργασίες και την εμπορική έλξη που αναζητούμε τώρα τώρα . “
Deepmind στην άκρη, υπάρχουν αρκετές επιχειρηματικές επιχειρηματικές επιχειρήσεις και ScaleUps που θέλουν να φέρουν τους κόσμους του υπολογισμού και της βιολογίας πιο κοντά, όπως το Cradle και το Bioptimus. Ο Kohl, από την πλευρά του, πιστεύει ότι είμαστε ακόμα σε επαρκώς πρώιμο στάδιο, όπου δεν γνωρίζουμε ακόμα ποια θα είναι η καλύτερη προσέγγιση όσον αφορά την αποκωδικοποίηση και το σχεδιασμό βιολογικών συστημάτων.
“Υπήρξαν μερικοί πολύ ενδιαφέροντες σπόροι που φυτεύτηκαν (για παράδειγμα) με το AlphaFold και μερικά άλλα πρώιμα γενετικά μοντέλα από άλλες ομάδες”, δήλωσε ο Kohl. “Αλλά αυτό το πεδίο δεν έχει συγκλίνει από την άποψη της προσέγγισης του καλύτερου μοντέλου ή από την άποψη του επιχειρηματικού μοντέλου θα λειτουργήσει εδώ. Νομίζω ότι έχουμε την ικανότητα να καινοτομούμε πραγματικά. “
