Η νέα γενετική ανάλυση επισημαίνει την αγορά της Γουχάν ως προέλευση του COVID

Μια νέα ανάλυση γενετικού υλικού που συγκεντρώθηκε από μια αγορά ζώντων ζώων στη Γουχάν τις πρώτες εβδομάδες της πανδημίας COVID-19 ενισχύει την υπόθεση ότι το ξέσπασμα ξεκίνησε εκεί όταν ο κοροναϊός μεταπήδησε από μολυσμένα ζώα σε ανθρώπους, δήλωσαν επιστήμονες.

Ο ευρήματαανέφερε το περιοδικό Cell, δεν προσδιορίζουν κανένα συγκεκριμένο μολυσμένο ζώο που έφερε τον ιό SARS-CoV-2 σε μια κινεζική πόλη που κατοικείται από περισσότερους από 11 εκατομμύρια ανθρώπους. Ούτε αποδεικνύουν οριστικά ότι η χονδρική αγορά θαλασσινών Huanan ήταν σημείο μηδέν για μια πανδημία που είχε ως αποτέλεσμα περισσότεροι από 7 εκατομμύρια θάνατοι.

Ωστόσο, τα γενετικά στοιχεία δείχνουν ότι η αγορά πληρούσε τις απαραίτητες προϋποθέσεις για να πυροδοτήσει μια επιδημία και καθιστά ολοένα και πιο δύσκολο να εξηγηθεί πώς ο κορωνοϊός θα μπορούσε να εμφανιστεί από ένα εργαστήριο, μια φάρμα ή ακόμα και από μια άλλη από τις τέσσερις αγορές ζώντων ζώων της πόλης, οι συγγραφείς της μελέτης. είπε.

«Είναι σαν να εμφανίστηκε ένας ιός γορίλλας στο Σαν Ντιέγκο και να χτύπησε πρώτα ανθρώπους που εργάζονταν στον ζωολογικό κήπο του Σαν Ντιέγκο και ζούσαν εκεί κοντά, μετά εξαπλώθηκε αργότερα ευρύτερα», δήλωσε ο Μάικλ Γουόρομπεϊ, εξελικτικός βιολόγος στο Πανεπιστήμιο της Αριζόνα που εργάστηκε στη μελέτη. . «Δεν θα ήταν δύσκολο να συλλογιστούμε ότι πολύ πιθανό να προήλθε από τους γορίλες του ζωολογικού κήπου».

Η βασική αιτία της πανδημίας έχει συζητηθεί έντονα από τις πρώτες μέρες της. Η Γουχάν φιλοξενεί ένα κυβερνητικό εργαστήριο όπου επιστήμονες μελετούν κορωνοϊούς παρόμοιους με τον SARS-CoV-2, γεγονός που ώθησε πολιτικούς, εμπειρογνώμονες εθνικής ασφάλειας, παρουσιαστές μεταμεσονύκτιας ομιλίας και πολλούς επιστήμονες – συμπεριλαμβανομένου του Worobey – να αναρωτηθούν εάν ο ιός είχε διαρρεύσει από το εργαστήριο.

Όσο συναρπαστικό κι αν είναι το επιχείρημα, λείπουν αδιάσειστα στοιχεία που να υποστηρίζουν την υπόθεση της διαρροής. Εν τω μεταξύ, ήρθαν στο φως περισσότερες πληροφορίες που έπεισαν επιστήμονες με πείρα σε σχετικούς τομείς ότι ο ιός που προκαλεί το COVID-19 προέρχεται από ζώα, όπως και οι ιοί που προκαλούν SARS, MERS και γρίπη.

Τα νέα αποτελέσματα συνεχίζουν αυτή την τάση, είπε Δρ Dominic Dwyerμέλος της διεθνούς ειδικής ομάδας που ερεύνησε την προέλευση της πανδημίας για τον Παγκόσμιο Οργανισμό Υγείας.

«Βάζεις όλες αυτές τις υποθέσεις προέλευσης στο τραπέζι και μετά μερικές από αυτές γίνονται ισχυρότερες καθώς λαμβάνεις στοιχεία», είπε ο Dwyer, ιατρός ιολόγος στο Πανεπιστήμιο του Σίδνεϊ και το Νοσοκομείο Westmead στην Αυστραλία που δεν συμμετείχε στην τελευταία εργασία. . “Αυτό το έγγραφο έχει περισσότερα στοιχεία που υποστηρίζουν τη ζωική προέλευση μέσω της αγοράς Huanan.”

Η ανάλυση που δημοσιεύτηκε την Πέμπτη βασίστηκε σε γενετικά δεδομένα που συγκεντρώθηκαν από εκατοντάδες δείγματα που συλλέχθηκαν μέσα και γύρω από την αγορά Huanan που συνέλεξαν ερευνητές από το Κινεζικό Κέντρο Ελέγχου και Πρόληψης Νοσημάτων αμέσως μετά το κλείσιμο της αγοράς την 1η Ιανουαρίου 2020. Η κινεζική ομάδα ανίχνευσαν τον κοροναϊό σε 74 από τα περιβαλλοντικά δείγματα που εξέτασαν, σύμφωνα με την περσινή έκθεσή τους στο περιοδικό Nature.

Ο Worobey και οι συνεργάτες του έσκαψαν βαθύτερα αυτά τα δεδομένα. Χρησιμοποιώντας δύο διαφορετικές τεχνικές γονιδιακής αλληλουχίας, αναζήτησαν κομμάτια SARS-CoV-2 καθώς και DNA από ζώα και ανθρώπους.

Στη συνέχεια σχεδίασαν ό,τι βρήκαν σε έναν χάρτη της μεγάλης αγοράς, επιτρέποντας στην ομάδα να ανακατασκευάσει πώς μερικές αρχικές λοιμώξεις θα μπορούσαν να έχουν μετατραπεί σε μια παγκόσμια έκτακτη ανάγκη για την υγεία.

Μεταξύ 585 δειγμάτων που συγκεντρώθηκαν στις αρχές Ιανουαρίου 2020, αυτά που περιείχαν τον κοροναϊό συγκεντρώθηκαν στο νοτιοδυτικό τμήμα της αγοράς. Αυτή έτυχε να είναι η περιοχή όπου τα άγρια ​​ζώα κρατούνταν σε κλουβιά προς πώληση.

«Η αγορά καλύπτει μερικά στρέμματα και αυτό φτάνει σε μια γωνιά της αγοράς και σε μερικούς πάγκους», είπε ο Dwyer. «Αυτό ταιριάζει με ζωική προέλευση. Αν προερχόταν από ανθρώπους που τριγυρνούσαν στην αγορά, θα το έβρισκες παντού».

Ένας πάγκος της αγοράς «ξεχώρισε», έγραψαν οι συγγραφείς της μελέτης. Είχε στοιχεία του SARS-CoV-2 σε πολλά σημεία: σε τουλάχιστον ένα καρότσι, σε ένα σιδερένιο δοχείο, στο έδαφος και σε ένα μηχάνημα που χρησιμοποιείται για την αφαίρεση μαλλιών και φτερών. Οι ερευνητές το ονόμασαν «στάβλο άγριας ζωής Α».

Άλλα 60 δείγματα λήφθηκαν από το σύστημα αποχέτευσης της αγοράς στα τέλη Ιανουαρίου 2020. Οι ερευνητές βρήκαν γενετικά στοιχεία του κορωνοϊού σε τέσσερα από αυτά, συμπεριλαμβανομένου ενός μπροστά από τον πάγκο άγριας ζωής Α.

Αυτή η αποχέτευση ήταν ακόμα θετική για SARS-CoV-2 στα μέσα Φεβρουαρίου. Το ίδιο και δύο αποχετεύσεις κατάντη από αυτό που θα μπορούσαν να είχαν μολυνθεί από την απορροή από το στάβλο άγριας ζωής Α, έγραψαν οι ερευνητές.

Τα δείγματα από το στάβλο που περιείχε τον κορωνοϊό περιείχαν επίσης DNA από μια ποικιλία ζώων, συμπεριλαμβανομένων σκύλων, κουνελιών, αρουραίων από μπαμπού, χοιροειδών της Μαλαισίας και μασκοφόρου φοίνικα. Το πιο άφθονο DNA ήταν από σκύλους ρακούν και μερικά εντοπίστηκαν σε ένα κοντινό καρότσι σκουπιδιών που επίσης βρέθηκε θετικό στον ιό.

Οι πιο γνωστοί συγγενείς του SARS-CoV-2 που υπάρχουν στη φύση είναι κοροναϊοί που κυκλοφορούν σε πέταλο νυχτερίδες στη νότια Κίνα, το Λάος και το Βιετνάμ και σε παγκολίνους από τη νότια Κίνα. Αλλά δεν βρέθηκε DNA από νυχτερίδες ή παγκολίνους σε κανένα από τα δείγματα της αγοράς Huanan.

Σκύλοι ρακούν, μασκοφόροι φοίνικα, αρουραίοι από μπαμπού και σκαντζόχοιροι της Μαλαισίας έχουν μεταδώσει στο παρελθόν κορονοϊούς νυχτερίδων, σημείωσαν οι συγγραφείς της μελέτης. Θα μπορούσαν να το έκαναν στη Γουχάν, αναρωτήθηκαν;

Δεν είναι σαφές εάν οι αρουραίοι από μπαμπού ή οι σκαντζόχοιροι της Μαλαισίας μπορούν να μολυνθούν από τον SARS-CoV-2, έγραψαν οι συγγραφείς της μελέτης. Δεν υπάρχουν σκληρές ενδείξεις ότι τα καλυμμένα φοίνικα μπορούν να κολλήσουν τον ιό, αλλά οι κυτταρικές σειρές από τα ζώα ήταν ευαίσθητες σε εργαστηριακά πειράματα.

Τα σκυλιά ρακούν, από την άλλη πλευρά, είναι γνωστό ότι πιάνουν και μεταδίδουν τον SARS-CoV-2. Και ήταν το πιο άφθονο ζώο στον πάγκο άγριας ζωής Α.

Οι ερευνητές έσκαψαν το DNA του σκύλου ρακούν για να δουν αν θα μπορούσαν να είχαν έρθει από τη νότια Κίνα, όπου μπορεί να είχαν διασταυρωθεί με νυχτερίδες. Δεν μπορούσαν να το πουν, αλλά μπόρεσαν να αποκλείσουν τη σύνδεση με σκύλους ρακούν που ζούσαν σε φάρμες γουναρικών στη βόρεια Κίνα.

Ο Worobey και οι συνεργάτες του μελέτησαν επίσης ζωικούς ιούς που δεν είναι SARS-CoV-2 που ανιχνεύθηκαν σε πάγκους άγριας ζωής για να δουν εάν έδιναν στοιχεία σχετικά με την προέλευση των μολυσμένων ζώων.

Ένας κοβουϊός που μόλυνε τα μοσχοκάρυδα στην αγορά Χουανάν σχετιζόταν στενά με έναν ιό που ανιχνεύθηκε σε ζώα που πωλούνται στις επαρχίες Σιτσουάν και Γκουανγκσί, οι οποίες βρίσκονται πιο κοντά στην επικράτεια των πέταλων νυχτερίδων και των παγκολίνων. Και ένας betacoronavirus που μόλυνε αρουραίους μπαμπού είχε έναν στενό συγγενή σε μια φάρμα αρουραίων μπαμπού στο Guangxi, μία από τις δύο νότιες επαρχίες όπου οι πωλητές της αγοράς ήταν γνωστό ότι είχαν προμηθευτεί τα ζώα.

«Αυτά τα ευρήματα υποδηλώνουν κάποια μετακίνηση μολυσμένων ζώων από τη νότια Κίνα στη Γουχάν, έναν εμπορικό αγωγό που θα μπορούσε επίσης να οδηγήσει στην εμφάνιση του SARS-CoV-2», έγραψαν οι συγγραφείς της μελέτης.

Για να εξαλειφθεί αυτό θα απαιτηθεί περισσότερη έρευνα, συμπεριλαμβανομένης της επιτόπιας εργασίας για τη συλλογή δειγμάτων από ζώα στην Κίνα, δήλωσε η Florence Débarre, εξελικτική βιολόγος στο Εθνικό Κέντρο Επιστημονικής Έρευνας της Γαλλίας στο Παρίσι και επικεφαλής συγγραφέας της μελέτης. Ο Worobey είπε ότι σχεδιάζει να συνεχίσει αυτή τη γραμμή έρευνας.

Ο Dwyer επαίνεσε την προσπάθεια να προσδιοριστεί από πού προέρχονταν τα ζώα στην αγορά – και κατ’ επέκταση, πώς ο ιός θα μπορούσε να έχει φτάσει στην αγορά.

Μια δεύτερη σειρά αποδεικτικών στοιχείων υποστηρίζει επίσης την υπόθεση ότι η πανδημία είχε τη λεγόμενη ζωονοσογόνο προέλευση, είπαν οι επιστήμονες.

Μεταξύ των δειγμάτων που συλλέχθηκαν στην αγορά Huanan την 1η Ιανουαρίου 2020, οι ερευνητές μπόρεσαν να αναγνωρίσουν τέσσερα σχεδόν πλήρη γονιδιώματα SARS-CoV-2. Ένας από αυτούς ήταν από τη λεγόμενη γενεαλογία Α και οι άλλοι τρεις ήταν από τη στενά συγγενή γενεαλογία Β.

Οι ερευνητές δεν μπόρεσαν να πουν εάν αυτοί οι ιοί μεταφέρθηκαν από ζώα ή ανθρώπους, αλλά η γενεαλογία Ένα δείγμα προήλθε από ένα πάγκο όπου ένας εργαζόμενος αναζήτησε ιατρική βοήθεια στα μέσα Δεκεμβρίου 2019. Αν και αυτό ήταν εβδομάδες πριν από την αναγνώριση του COVID-19 ως ασθένεια, μια έκθεση από τον Παγκόσμιο Οργανισμό Υγείας περιέγραψε αργότερα τον εργαζόμενο ως ύποπτο πρώιμο ασθενή.

Η επιβεβαίωση της παρουσίας και των δύο γενεών στην αγορά επέτρεψε στην ομάδα να συγκρίνει τα γονιδιώματά τους και να εργαστεί προς τα πίσω για να καταλάβει πότε τα δύο στελέχη αποκλίνουν και πώς έμοιαζε ο πιο πρόσφατος κοινός τους πρόγονος. Κατέληξαν σε έξι υποψηφίους, μερικοί από αυτούς πιο εύλογοι από άλλους.

Υπήρχε 99% πιθανότητα ένας από τους τέσσερις πιο πιθανούς υποψηφίους να ήταν σωστός και όλοι αυτοί οι τέσσερις είχαν κάτι σημαντικό κοινό: Ήταν «ισοδύναμα ή πανομοιότυπα» με τον πιο πρόσφατο κοινό πρόγονο για την πανδημία στο σύνολό του, είπε ο επικεφαλής της μελέτης Alexander Crits-Christoph, ανεξάρτητος υπολογιστικός μικροβιολόγος.

Αυτό θα περίμεναν να βρουν εάν το ξέσπασμα άρχιζε στην αγορά Χουανάν, είπαν οι συγγραφείς της μελέτης. Σε αυτό το σενάριο, ένα ζώο ή ζώα μολυσμένα με τον ιό έφτασε στην αγορά τον Νοέμβριο ή αρχές Δεκεμβρίου. Στη συνέχεια, ο ιός εξαπλώθηκε μεταξύ των ζώων που κρατούνταν σε στενούς χώρους σε εσωτερικούς χώρους, καθώς και στους ανθρώπους που τους χειρίζονταν. Αυτές οι συνθήκες θα έδιναν στον ιό τις πολλαπλές πιθανότητες που χρειαζόταν για να εγκατασταθεί στους ανθρώπους και να αρχίσει να εξαπλώνεται στους νέους ξενιστές του σε μια πυκνοκατοικημένη πόλη.

Από την άλλη πλευρά, γίνεται όλο και πιο δύσκολο να ενσωματωθούν όλα αυτά τα στοιχεία σε μια συνεκτική ιστορία που λέει ότι ο κορωνοϊός εισέρχεται στην Κίνα μέσω εισαγόμενων κατεψυγμένων τροφίμων (όπως ισχυρίστηκε η κινεζική κυβέρνηση) ή δραπετεύει από ένα εργαστήριο ιολογίας με χαλαρά πρωτόκολλα βιοασφάλειας (όπως μερικοί μέλη της κοινότητας πληροφοριών των ΗΠΑ έχουν προτείνει), είπε ο Dwyer.

«Δεν έχουμε προσθέσει τίποτα για να υποστηρίξουμε τη διαρροή εργαστηρίου ή τις θεωρίες κατεψυγμένων τροφίμων», είπε. «Απλώς συνεχίζει να ενισχύει την υπόθεση των ζώων και της αγοράς».

Λαμβάνοντας υπόψη ότι η πανδημία ξεκίνησε σε μια πόλη με ένα εργαστήριο ιολογίας όπου οι επιστήμονες μελετούν τους κοροναϊούς, είναι λογικό να αναρωτιόμαστε αν αυτό είναι κάτι παραπάνω από σύμπτωση και να αναρωτιόμαστε αν καλύπτονται ενοχοποιητικά στοιχεία, είπε ο DéBarre.

«Πολλοί από εμάς ήμασταν εξαιρετικά ανοιχτοί σε αυτή την ιδέα», είπε. «Αλλά στη συνέχεια συσσωρεύτηκαν δεδομένα και όλα πηγαίνουν προς την ίδια κατεύθυνση – όλα δείχνουν προς την αγορά».

«Στην επιστήμη πολύ σπάνια έχεις τελικές απαντήσεις», πρόσθεσε. «Λέτε, «Δεδομένων όλων των δεδομένων που έχουμε, αυτή μοιάζει με την πιο πιθανή ερμηνεία».